Le traitement dépend de la forme et de l'étendue de la maladie. Certaines petites anomalies se corrigent d'elles-mêmes avec le temps, d'autres ne nécessitent pas de traitement. Un autre exemple est celui des maladies plus graves.
Le traitement médicamenteux (thérapie pharmacologique) vise à soulager la gêne et, si nécessaire, à soutenir la fonction cardiaque.
Dans la plupart des cas, une intervention invasive est nécessaire = chirurgie ou cathétérisme.
Le cathétérisme est réalisé à l'aide d'un cathéter, un long tube flexible qui est inséré dans un vaisseau sanguin et qui permet d'accéder au cœur à travers le système vasculaire.
La solution chirurgicale est réalisée par une opération à cœur ouvert à travers le thorax. Le cœur est arrêté pendant l'intervention à l'aide d'une circulation extracorporelle.
Exemple :
La transplantation est nécessaire si la cardiopathie congénitale ne peut être corrigée par la chirurgie.